Khoa Giáo dục Quốc phòng - Trường đại học Giao thông Vận tải được thành lập ngày 2 tháng 5 năm 1984 theo Quyết định số 1023/QĐ-TCCB của Bộ trưởng bộ Giao thông Vận tải. Khoa hiện có 11 CBVC, trong đó:

- Giảng viên: 10 đồng chí là Sĩ quan biệt phái của Binh chủng Công binh (có 6 Thạc sĩ và 4 Cử nhân);

- Chuyên viên văn phòng: 01 đồng chí.

 Cơ cấu của Khoa gồm có 02 bộ môn (Bộ môn Giáo dục chính trị - Quốc phòng, an ninh; Bộ môn Chiến thuật - Quân sự chung) và Văn phòng khoa. Chi bộ khoa gồm 11 đảng viên trực thuộc Đảng bộ Trường và Tổ Công đoàn trực thuộc Công Đoàn trường.

Trong gần 40 năm qua, Khoa Giáo dục quốc phòng luôn thực hiện tốt công tác tuyên truyền giáo dục nâng cao nhận thức, ý thức trách nhiệm cho sinh viên; bồi dưỡng lòng yêu nước, truyền thống đấu tranh anh dũng vẻ vang của Quân đội, góp phần quan trọng trong chiến lược đào tạo toàn diện nguồn nhân lực có chất lượng cao trong lĩnh vực Giao thông vận tải cho Đất nước.

Được sự quan tâm lãnh đạo của Đảng ủy, Ban Giám hiệu và sự cố gắng nỗ lực của toàn đơn vị, Khoa Giáo dục quốc phòng đã hoàn thành tốt nhiệm vụ giảng dạy môn học Giáo dục quốc phòng (nay là môn học Giáo dục quốc phòng và an ninh) cho 37 khoá sinh viên với hơn 50000 sinh viên được học và cấp chứng chỉ Giáo dục quốc phòng và an ninh. Trong công tác đào tạo sĩ quan dự bị: Từ năm 1984 đến 1990 Khoa trực tiếp giảng dạy và đào tạo sĩ quan dự bị cho 7 khoá sinh viên sau tốt nghiệp với thời gian 3 tháng được 533 sinh viên, thực hiện tốt công tác xây dựng lực lượng dự bị động viên cho Quân đội. Từ năm 1990 đến nay, nhu cầu đào tạo sĩ quan dự bị có sự thay đổi, số lượng sinh viên được tuyển chọn đào tạo sĩ quan dự bị giảm so với trước, do đó Khoa chỉ thực hiện tuyển chọn, gửi đi đào tạo tại các trường trong Quân đội. Khoa đã thực hiện tuyển chọn được 8 khóa với 380 sinh viên tốt nghiệp thành sĩ quan dự bị; Nhiều học viên sau khi tốt nghiệp khóa học sĩ quan dự bị đã trực tiếp tham gia xây dựng Quân đội nhân dân Việt Nam.