Khoa Môi trường và An toàn Giao thông, trước đây là Viện Khoa học và Môi trường Giao thông, được thành lập theo Quyết định số 754/QĐ-TCCB ngày 28/6/2004của Hiệu trưởng Trường Đại học Giao thông Vận tải (tiền thân là Trung tâm Khoa học Công nghệ Môi trường Giao thông, thành lập từ năm 1996). Ngày 09/11/2012, Viện Khoa học và Môi trường Giao thông đổi tên thành Viện Môi trường và An toàn giao thông theo quyết định số 2431/QĐ-ĐHGTVT. Từ 04/12/2015 Viện Môi trường và An toàn giao thông đổi tên thành Khoa Môi trường và An toàn giao thông theo quyết định số 2328/QĐ-ĐHGTVT.

          Bên cạnh đội ngũ cán bộ giảng dạy nhiều kinh nghiệm và lực lượng khoa học trẻ giàu nhiệt huyết được đào tạo ở CHLB Đức, Ba Lan, CH Pháp, Trung Quốc, Khoa Môi trường và An toàn giao thông còn quản lý Phòng thí nghiệm môi trường VILAS 127 và Phòng thí nghiệm an toàn giao thông với các trang thiết bị đo lường hiện đại.

          Từ khi thành lập đến nay, Khoa Môi trường và An toàn giao thông đã chủ trì và nghiệm thu nhiều đề tài nghiên cứu khoa học cấp Bộ, thực hiện hàng trăm hợp đồng tư vấn lập dự án thiết kế kỹ thuật, thi công, đánh giá tác động môi trường công trình giao thông, thiết kế sản xuất lắp ráp và đảm bảo an toàn phương tiện, tư vấn điều tra tai nạn giao thông,...

          Trong thời gian qua, Khoa Môi trường và An toàn giao thông đã thực hiện nhiều đề tài nghiên cứu khoa học và chuyển giao công nghệ trong lĩnh vực bảo vệ môi trường và an toàn giao thông, điển hình là các đề tài:

     - Nghiên cứu sử dụng khí ga hoá lỏng trên ô tô.

     - Nghiên cứu ứng dụng chất xúc tác tiết kiệm nhiên liệu và giảm ô nhiễm môi trường cho ô tô, xe máy.

     - Nghiên cứu quy hoạch và thiết kế các trạm nghỉ và dịch vụ giao thông vận tải đường bộ.

     - Nghiên cứu lập dự án đầu tư xây dựng nhà máy sản xuất lắp ráp ô tô, các công trình phục vụ an toàn giao thông.

     - Nghiên cứu xây dựng hệ thống cấp nước sạch và nhà vệ sinh cho các trường tiểu học.

     - Đánh giá tác động môi trường của các nhà máy và dự án xây dựng công trình giao thông.

     - Thiết kế sản xuất lắp ráp và cải tạo các loại phương tiện giao thông vận tải đường bộ.

     - Tư vấn lập dự án đầu tư và thực hiện thiết kế kỹ thuật- thi công các trung tâm sát hạch lái xe ô tô.

     - Tư vấn điều tra một số vụ tai nạn giao thông nghiêm trọng.